La principal diferencia con respecto a los modelos anteriores es la introducción de algo llamado 3D Touch, que es la evolución natural de la tecnología multi-touch de Apple. Similar al Force Touch en el Apple Watch, un usuario puede presionar la pantalla utilizando un poco más de fuerza para acceder a un nuevas funcionalidades, tanto en iOS o dentro de las apps. Además, puede proporcionarle a los usuarios cierta retroalimentación táctica en forma de vibraciones.

Para demostrar esta nueva funcionalidad, Craig Fererighi de Apple mostró como puedes  echar un "vistazo" a un mensaje en la aplicación de email o a un evento en el calendario y después presionar más fuerte para mostrar más funciones. Otro ejemplo de esta nueva tecnología dentro de iOS es el siguiente: si presionas la pantalla del iPhone, justo abajo de la cámara frontal,  se abre la aplicación de la Cámara, activada en modo selfie. 

Quizás el 3D Touch sea un poco confuso de visualizar sin estar literalmente utilizándolo, pero lo podemos imaginar como algo así: en una pc o laptop, si posicionamos el cursor sobre un botón o imagen (por ejemplo) nos aparece un pequeño mensaje informativo o tooltip, si damos un click derecho, se abre una nueva gama de opciones disponibles. El 3D Touch es algo similar, presionas normal para realizar la acción, o presiona más intensamente para activar otros menús, o realizar una acción diferente.

Al iPhone 6S le da su power el nuevo procesador A9, el cual Apple jura y perjura es 70% más rápido que el A8 (el chip del iPhone 6), y mejora en un 90% el rendimiento en gráficos.

Apple dice que el 6S es el primer iPhone en contar con el nuevo co-procesador de movimiento - ahora llamado M9 - integrado en el chip. Gracias a este co-procesador, es posible tener activada siempre la opción de "Hey Siri". Esta opción permite activar Siri (el asistente de iOS) sin presionar ningún botón, simplemente diciendo esas palabras. Antes sólo se podía activar esta modalidad cuando el teléfono estaba conectado a la corriente, ya que consume demasiada batería estar siempre escuchando para identificar la frase "Hey Siri", pero al parecer este nuevo chip incluye un módulo dedicado específicamente a esta tarea.

Tal como se esperaba, la cámara fue mejorada notablemente. La cámara trasera es de 12 megapixeles. El sensor de la cámara tiene 50% más pixeles, lo cual ayuda a reducir considerablemente el ruido en las imagenes.

Algo importante es que la cámara trasera ahora es capaz de grabar vídeo en 4K y claro, le dieron a iMovie la capacidad de editar 4k.  

También mejoraron mucho la cámara frontal, ahora es de 5 megapixeles, y Apple implemento una funcionalidad donde la pantalla del iPhone puede utilizarse como una especie de flash. Básicamente pone la pantalla en blanco y le sube el brillo.

Otra inovación: El iPhone 6S puede capturar un nuevo tipo de medio llamado Live Photo. Técnicamente son fotos convencionales, pero se capturan de - manera automática - unos segundos de vídeo, que el usuario puede ver presionando la foto con fuerza (utilizando el 3d Touch). Esto no es nada nuevo, por varios años  diferentes cámaras digitales y algunas aplicaciones, pueden capturar vídeo instantes antes y después de que se tomó la foto, para - de esta manera - compartir un poco el "momento" en que se tomó y no solo la imagen. Pero claro, ahora que Apple lo está implementando como "Live Photos", Facebook ya anunció que integrará esta funcionalidad antes de que termine el año.

Le ha de haber molestado mucho a Apple todo el asunto del "Bendgate", por eso los nuevos iPhones están fabricados con aluminio serie 7000, según Apple, este material es mucho más resistente a las dobladuras que el aluminio utilizado en modelos previos.

6S vs 6S Plus. Similar a la generación anterior de iPhones, las diferencias claves entre el 6S y el 6S Plus son:  mejor cámara trasera - ya que incluye estabilizador de imagen -, pantalla más grande y batería más duradera.